وظایف شورای عالی مرکز به شرح زیر است:
- تصویب خط مشی پژوهشی مرکز
- تصویب طرح هایی جهت همکاری با سایر دانشگاهها و موسسات آموزشی-پژوهشی داخل و خارج کشور و سازمانهای بین المللی مطابق مقررات و ضوابط مربوطه
- بررسی تصویب گزارش سالیانه فعالیتهای مرکز
- بررسی و تصویب بودجه سالیانه مرکز
- تصویب دستورالعملهای مربوطه
- پیشنهاد سازمان و تشکیلات مرکز