مرکز تحقیقات علوم اعصاب خود را مأمور به انجام موارد ذیل می داند:
- پژوهش، نوآوری و تولید علم در زمینه علوم اعصاب از سطح مطالعات پایه تا انتقال یافته های بنیادی به مطالعات بالینی
- اجرای همکاری های مؤثر و کارآمد میان رشته ای در سطوح مختلف پایه و بالینی
- کاربردی کردن نتایج پژوهش و تجاری سازی آن
- فراهم کردن زمینه آشنایی محققین بالینی در زمینه علوم اعصاب به مباحث پیشرفته در علوم پایه اعصاب
- آموزش و تربیت نیروی انسانی متخصص در زمینه علوم اعصاب